万方查重系统是一款专业的文本查重工具，旨在帮助用户检测文档的原创性。免费版通常提供基础的查重功能，适合个人用户或小型团队使用。免费版的使用范围可能受到限制，例如每日查重次数、文档大小等。而付费版通常提供更多高级功能，如专业查重算法、扩展的数据库覆盖等，适合对文档原创性要求更高的用户或大型团队使用。用户可以根据自身需求和预算来选择适合的版本。

免费版的万方查重系统可能会受到一些限制，如查重速度较慢、覆盖的数据库较小等。而付费版通常提供更快速、更准确的查重服务，同时支持更大规模的文档查重。此外，付费版可能还会提供更多的定制化服务，如定制查重规则、定制数据库等，能够更好地满足用户的个性化需求。因此，如果您对文档查重的准确性和速度有更高要求，或者需要更多定制化的服务，付费版可能更适合您。